公司因迟到问题扣工资

如果你发现公司因迟到扣款超过了基本工资的20%，这违反了劳动法的相关规定（虽然劳动法未直接规定迟到扣款，但扣款上限可参考工资支付的相关规定，确保扣款不侵犯员工合法权益）。你可以首先与公司人力资源部门沟通，要求解释并纠正。若沟通无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，或依据《劳动争议调解仲裁法》第五条，申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
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若公司规章制度中未明确迟到扣款标准，但实际执行中进行了扣款，这是不合法的。因为扣款行为需要有明确的制度依据。在此情况下，你可以要求公司提供明确的扣款依据，若无依据，你有权拒绝扣款并要求返还已扣款项。若公司坚持，你可以考虑通过法律途径解决。
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从法律角度，公司制定迟到扣款制度需注意：确保制度内容合法，扣款标准合理且不侵犯员工合法权益；制度需经民主程序制定并向员工公示；扣款时严格遵守制度规定，确保扣款不超过基本工资的20%；同时，保留好扣款的相关记录和证据，以备不时之需。